去離子水處理設備的出水水質比較高，可以用于化工、醫藥、食品等行業生產用水。設備在運行前需要做一些準備，比如對水質的檢查：濁度、SDI值、PH值、細菌、微生物、余氯等，要達到設計要求進水指標后才可以輸入超濾系統，否則會破壞去離子水處理設備。
去離子水處理設備在運行之前還要對相關管路以及設備清洗，一方面是清洗掉碎屑、有害物質，另一方面是對系統做整體滅菌處理，以免細菌滋長影響水質。可以采用分段清洗的方式，按照工藝流程從前向后一次進行。再有就是去離子水處理設備閥門檢查，保證可以正常開啟、關閉。
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